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生物学研究中,什么是TOPflash和FOPflash?

生物学研究中,什么是TOPflash和FOPflash?

定义:
一种测定细胞内beta-catenin介导的转录活性的方法(经典wnt信号通路)!
最早由Hans Clevers实验室构建,但其信噪比不佳,后面由AjameteKaykas改良!
原理:
经典的Wnt信号通路需要beta-catenin入核,进而与转录因子TCF/LEF结合形成复合物,共同起始下游调控基因的转录。据此,科学家通过将数个拷贝的TCF/LEFDNA结合位点(AGATCAAAGGgggta,大写碱基为DNA结合序列,小写的碱基为间隔序列)克隆至含TA病毒最小启动子(minimalTA viral promoter )的萤火虫荧光素酶报告系统载体中,构建得到TOP-Flash质粒。该质粒可依据beta-catenin的活性强弱,调控下游萤火虫荧光素酶的表达量高低。进而将实验简化为检测荧光素酶的活性。同时为了减少误差,该系统还设计了包含突变的TCF/LEFDNA结合位点的对照质粒,即FOP-Flash载体。
由于荧光素酶报告系统的高灵敏性,为了减少操作误差,我们在平时使用时,往往还需要连同一个表达海肾荧光素载体,作为内对照,从而消除细胞活力、转染效果、裂解效果等系统误差(同双荧光素酶报告基因检测系统)!具体的TOP或FOP质粒与海肾荧光素载体的比例,需要个人通过实验优化,通常取值的范围在10/1到50/1。
数据处理:
通常以TOP/FOP的比值表示。
公式如下:
转染有TOP-Flash和海肾荧光素载体的样本中采集得到的萤火虫荧光值F(Top)/采集得到的海肾荧光值R(Top)

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