2014年，清华大学召开了第24次教育工作讨论会，确立了价值塑造、能力培养、知识传授“三位一体”的教育模式，明确了专业学位研究生教育主要培养具有职业素养、创业精神的高层次专门人才，学术学位硕士生根据学科特点或作为博士生培养的补充与准备阶段，或培养应用型人才的培养定位，并提出完善学术学位与专业学位研究生分类培养机制。随着专业学位研究生教育改革不断推进和深化以及专业学位硕士生日渐成为学校硕士生培养的主体，原《规定》已不能适应硕士生培养的新形势和新要求。在此背景下，2016年7月，学校将《规定》的修订工作列入《制度建设五年任务分解方案（2016-2020年）》，2017年1月正式启动修订。

本次修订历时四年，这一期间党和国家提出了一系列与研究生教育相关的新理念、新要求和新举措。清华大学及时学习党的十九大、全国高校思想政治工作会议、全国教育大会和全国研究生教育会议精神以及国家关于研究生教育改革发展、教育和科技评价改革等文件的要求，并贯彻落实到《规定》修订工作中。学校还针对硕士生教育开展了广泛的研讨和调研，凝聚师生共识。2017年10月至2018年5月，全校开展“硕士研究生培养定位、规模和实现路径”研讨会，并列为学校第25次教育工作讨论会议题之一。经过广泛研讨，学校形成了一流硕士生教育体现人才培养的活力、是培养行业人才的主渠道和深度参与产学研合作的重要抓手的共识。2019年4月，学校发布《关于完善学术评价制度的若干意见》，全面启动完善研究生学位评定标准工作，历经一年多时间的研讨，于2020年6月在全国率先完成。2020年7月全国研究生教育会议召开后，学校开展研究生教育改革研讨月活动，进一步总结经验、找准问题、形成举措，并于2021年2月出台了《关于在新发展阶段进一步深化研究生教育改革的若干意见》。《规定》修订稿充分吸收了历次研讨的相关成果，并在成稿后在全校范围公开征求意见。