长江口生态监控区是全国范围内实施生态监控区制度的18个典型生态系统之一。监控区位于上海市近岸海域, 作为河口与海洋的交汇区域, 受长江冲淡水、沿岸流、台湾暖流和黑潮的影响, 加上航道整治、滩涂围垦以及长江上游大型水利工程建设引起的水动力条件变化, 造就了复杂多变的环境。长江流域承载流经地区的工、农业废水和城市污水, 将大量生源要素(碳、氮、磷等)、有机污染物、重金属等从陆地带入长江口海域, 对该区域生态环境造成了极大的影响, 水体富营养化严重、赤潮频发(周名江等, 2003; 范丽等, 2008; 张璇, 2012; 尹艳娥等, 2014; 张桂成, 2015)。

浮游植物是赤潮发生的生物基础, 作为初级生产者, 其种群变动和群落结构直接影响海洋生态系统的结构和功能。对长江口及其毗邻海域浮游植物研究的报导已有很多, 内容涵盖种类组成、数量分布、生物多样性、浮游植物群落与环境因子关系等(Gao et al, 2005; Kong et al, 2009; Zhu et al, 2009; Yang et al, 2014; Jiang et al, 2015; 李云等, 2007; 栾青杉等, 2007; 王丹等, 2008; 何青等, 2009; 章飞燕, 2009; 栾青杉等, 2010; 唐峰华等, 2010; 王江涛等, 2012; 赵冉等, 2013; 林峰竹等, 2008; 江志兵等, 2014; 刘海娇等, 2015; 林梅等, 2017), 但由于受到样本和数据的限制, 这些研究主要是基于一次调查或者是短时期内群落结构变化, 长期趋势变化分析只能依赖历史文献材料收集, 所分析的材料往往存在不同年份调查区域、调查时间不一致的情况, 即使是在同一年份, 也存在调查站位个数有限, 调查资料不完整等问题, 不足以反映研究区域浮游植物多年连续变化情况。