南京大学口腔医学教育始建于1935年国立中央大学牙医专科学校。1994年复办，1997年开始招收本硕连读专业。2008年经教育部批准设立口腔医学本科一级学科， 2010年设立口腔医学硕士一级学科和口腔硕士专业学位授权点，2012年设立南京大学口腔科学二级博士点，2019年设立口腔博士专业学位授权点，是江苏省“十三五”重点（培育）学科。附属口腔医院是华大地区规模最大的三级甲等口腔医院，在国内专科学科排名及科技影响力排名前十。现为国家级住院医师规范化培训基地，国家级专科医师规范化培训基地，中华口腔医学会住院医师规培师资培训基地；国家执业医师考试基地。国家药物临床试验机构。设有院士工作站和博士后创新基地。

学科有专任教师104人，其中45 岁以下专任教师79%，获博士学位教师75%；有高级职称教师占72%，硕士研究生导师36人，博士研究生导师10人。中国工程院院士邱蔚六院士为口腔医学院名誉院长，学术带头人胡勤刚教授为中国医师协会口腔医师分会副会长，闫福华教授与王铁梅教授分别为中华口腔医学会牙周专委会和口腔颌面影像专委会主任委员。学科以口腔疾病临床研究与教学为优势。主攻方向包括口腔癌的可视化、多模态诊疗；基于多源数据融合的牙颌颅面功能性修复技术；牙及牙周疾病机制及防治研究；口腔与全身疾病关系研究；以炎症控制为基础的工程化牙周组织再生研究；以关节-骨-咬合重建来改善颌骨畸形缺损的研究等。

口腔医学院以培养“具有高尚医德和人文情怀的科研临床双优型口腔医学专业人才”为办学目标，素以严格规范的专业学位教育享誉国内口腔医学界。建立了本研贯通一体化专业学位培养制度，实施严谨科学的结构化“口腔医学毕业生综合能力考核方案”，成为南京大学医学学科小规模、精品式培养的重要保证，形成了良性循环的社会影响力。本科招生为高考全省前1000余名学生，研究生生源985高校占比平均40%，每年统招初试分数线全校第一，招录比例为10:1。

学科重视国际交流，与美国University of Washington、The University of Michigan、UT MD Anderson Cancer Center，英国University of Leeds，日本Hokkaido University，荷兰Academic Center for Dentistry in Amsterdam，澳大利亚The Queensland University of Technology以及香港大学牙学院等国际知名口腔医学院全面开展了科研、临床、教学以及师生交换等方面的合作。目前有外聘兼职教授11人。在2019年我校与英国利兹大学基于十来年的稳定合作签订以建立南京大学-利兹大学口腔医学双学位研究生学历教育为核心的教学合作协议，将经典的英国医学教育与高质量南京大学培养进行完美结合，培养“科研临床双优型口腔医学人才”。同时，基于研究生课程建设的成绩，与荷兰奈梅亨大学、武汉大学等四所国内外院校共同申请获批欧盟高等教育项目。为了加强学生人文交流，本学科连续召开了两次国际口腔医学大学生人文与艺术夏令营，取得了很好的影响力。

口腔医学院以培养“具有高尚医德和人文情怀的科研临床双优型口腔医学专业人才”为办学目标，素以严格规范的专业学位教育享誉国内口腔医学界。