2014年获批交通运输工程专业学位授权领域，2017年，经学校批准成立城市智慧交通与安全运维研究院。

交通运输工程专业硕士点（深圳大学土木与交通工程学院）师资力量强大，拥有专任教师23人，博士率达100%，其中教授2人，副教授8人，博导3人，13人具有海外经历，广东省本科高校交通运输类专业教学指导委员会委员1人，广东省珠江人才青年拔尖人才2人，深圳大学荔园优青1人。同时学位点也高度重视思政建设，效果显著，2021年学位点所属支部获批“深圳大学第二批双带头人支部书记工作室”建设项目。

面向“交通强国”国家战略和粤港澳大湾区综合交通一体化建设的人才需求，深耕智慧交通、轨道交通、交通设施运维、现代物流等交叉学科领域，培养“应用型、创新型、复合型、国际化”高级人才。发展方向布局交通安全运维、智能交通系统、交通运输规划、以及交通物流四大领域，培养学生成为具有广阔视野、进取精神、创新能力和职业技能的复合型交通专业人才。

学位点构建了面向多类别/多层次生源的适配型创新人才培养体系，形成了结合湾区重大工程建设的协同育人模式。学位点制定了详细合理的培养方案，学制、学分和学术要求切实可行，关键环节考核标准和分流退出措施明确。

学位点建有多个国家、省市级实验室，主要包括极端环境绿色长寿道路工程全国重点实验室、自然资源部大湾区地理环境监测重点实验室、深圳市海上基础设施安全与监测重点实验室，同时与深圳市交通运输局、深圳市地铁集团等交通行业知名企事业单位建立了长期的合作关系。上述科研平台与合作单位为学位点培养学生提供了良好的科研条件与实践机会。

交通运输工程专业包含交通安全运维（交通基础设施智能感知与监测，交通系统运行管理、维护与安全运营）、智能交通系统（交通信息采集、处理和发布，智能交通规划，综合交通智能化设计，公交智能化综合管理与调度）、交通运输规划（现代交通可持续发展理论，公交主导的城市交通规划，公交规划与管理的理论与方法）和交通物流（网络流理论、物流网络优化、城市物流多式联运和港口物流）等四个培养方向。