南昌大学自动化系的历史最早可追溯至1958年江西工学院电机系工业企业自动化专业成立，2003年成立南昌大学信息工程学院电气与自动化工程系自动化专业；测控技术与仪器专业于2003年创立，并于2014年调整进入信息工程学院电气与自动化工程系。2019年因学科发展需要，成立自动化系。2022年2月，测控技术与仪器专业调整到先进制造学院。自动化系现有工业控制工程二级学科（自主设置）博士学位授予权点，控制科学与工程、控制工程两个硕士学位授权点，下设自动化本科专业。

自动化系1985年获得控制理论与控制工程(江西省重点学科)硕士学位授予权，这也是我校最早获得硕士学位授予权的专业，2000年获批控制科学与工程一级学科硕士学位授予权，2009年开始招收培养全日制控制工程专业学位研究生，2011年获批“工业控制工程”自主设置二级学科博士点。

自动化系下设自动化本科专业，自动化专业为省级特色专业，江西省一流专业。每年本科生招生人数在100人左右。目前自动化专业已成为江西省自动化专业领域的高层次人才培养基地，入选江西省一流专业，并通过国家工程认证。通过“恩智浦”杯智能汽车竞赛基地，江西省电子设计竞赛基地，“西门子杯”智能制造竞赛基地、大学生创客空间等平台，本科生可以积极地参与到各种科研和创新创业活动中。学生连续3年获得中国大学生互联网+创新创业比赛国家银奖，并多次获得“恩智浦”杯智能汽车竞赛全国一等奖和二等奖，“西门子杯”智能制造竞赛全国二等奖。自动化专业近五年每年平均招收本科生100余人，已经累计培养本科生4000 余人。

依托科技部863、973项目及重大国际合作专项，控制学科形成了“控制理论与控制工程”，“人工智能与模式识别”，“新能源转换与控制技术”、“检测技术与自动化装置”、“导航与机器人控制”这5个特色研究方向，在机器人、新能源、人工智能、生物医学、增强现实、智能检测、导航等领域取得丰硕的研究成果。学科依托江西省智能信息系统重点实验室、江西省嵌入式系统工程技术研究中心、南昌大学虚拟现实产业技术中心等平台在机器人、人工智能+医疗、新能源与控制、智能检测等领域的研究具有一定的特色和技术优势，并建立了广泛地国际化合作与产业联盟提升和扩大学科影响力，和美国、加拿大、澳大利亚、新加坡、日本、英国和法国等世界上排名领先的研究中心建立了稳定的合作关系。

控制学科已形成以1个国家千人、1个长江学者和多个省级人才为学科和方向带头人的高层次、高水平、结构合理，具有开展高水平基础研究和工程应用能力的学术梯队。现有教授10名，副教授15名，其中80%以上教师具有博士学位。控制学科每年硕士研究生招生人数在90人左右，2014年博士研究生开始招生。

南昌大学自动化系秉承南昌大学校训“格物致新，厚德泽人”，坚持“育人为本、创新引领、合建驱动、改革攻坚、实干兴校、拼争一流”，为国家培养自动化领域的专业人才。