发明专利和科研论文有类似的地方，也有不同之处。

论文和专利都属于技术文献，但实质有不同。

论文是某一学术课题在实验性,理论性或观测性上具有新的科学研究成果或创新见解和知识的科学记录,或是某种已知原理应用于实际中取得新进展的科学总结,用以提供学术会议上宣读,交流或讨论;或在学术刊物上发表;或作其他用途的书面文件,从这个定义来看,论文有时候完全是纯理论的东西,而且对论文所要表达的内容并无太多限制,只要是新的研究成果即可,包括纯理论的,如数学公式、科学发现等。论文带给作者的很多时候只是荣誉以及著作权。

专利明显不同，专利可保护的内容有限制，象数学公式、科学发现、外科手术方法、克隆技术等可以用论文形式发表的，都不能用专利来保护。这是内容的差别。

还有法律意义上的差别，专利实际上是专利权的简称，它是国家或地区给与专利权人的一种排他权，除非专利权人允许，他人不得实施同样的专利技术，法律强制性很强，但是论文则完全没有这种法律约束，你发表了论文，却不能影响别人实施你论文的技术（当然，侵犯著作权则是另外的事）

很多搞科研的人，很重视论文的发表，觉得那是体现学识优势的途径，但是不曾想，却也是免费教材。而且很多专家习惯先发表论文，然后再去考虑申请专利，却会因为论文的公开导致丧失新颖性。

发明专利申请书的第一部分为背景技术介绍，要求专利发明人对背景技术及其不足之处进行总结。科研论文第一步部分和发明专利申请书很类似，也是介绍前人的研究工作及不足之处。不同之处在于科研论文必须引用和列出相应的参考文献，而发明专利申请则可以不列参考文献。

发明专利申请书的第二部分为发明的技术方案。这部分和论文的方法（method)比较类似，但不同之处居多。这部分要求发明人用文字和公式阐述发明的技术方案，不能用图表。即使发明的技术方案用图表更容易说明问题，发明人也必须把图表内容转换成文字。尤其是涉及到复杂装置的技术方案，用文字表述需要特殊技巧。论文的方法部分则没有多少限制，论文撰写人可以选择更容易让读者理解和明白的论文撰写方式。可以有详细的公式推导和图表。

发明专利申请书的第三部分为实施例和发明专利,这部分要求发明人必须结合发明专利附图说明发明的具体实施方案。这部分和论文的实验部分类似，但差别很大。发明专利实施例为实现发明技术方案的一个或多个例子，很多论文的主体部分就相当于一个实施例。

发明专利申请书的第四部分为发明的技术效果，这部分和论文的结论部分类似。不同之处在于说明发明的技术效果一两句话就行了，也不需要基于严格的逻辑推理。而论文的结论部分则是基于对实验数据的分析和推理，可靠性高。

发明专利由专利审查人审查，重点判断发明的技术方案和现有文献有无重复之处。科研论文由同行审稿，重点判断实验数据是否可靠，结论是否准确。由于专利审查员一般不是同行，发明的技术效果无法通过专利审查保证。发明专利从申请到授权的周期一般为2年，科研论文的发表周期一般在一年之内。

申请专利的重点在于知识产权保护，发表科研论文的目的在于知识传播和分享。