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实时荧光定量PCR原理及RT

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什么是实时荧光定量PCR (RT-PCR,qPCR)?

实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)指的是在PCR进行的同时,对其过程进行监测的能力(即实时)。因此,数据可在PCR扩增过程中,而非PCR结束之后,进行收集。这为基于PCR的DNA和RNA定量方法带来了革命性的变革。在实时荧光定量PCR (qPCR)中,反应以循环中首次检测到目标扩增的时间点为特征,而非在一定循环数后目标分子累计的扩增量。目标核酸的起始拷贝数越高,则会越快观察到荧光的显著增加。相反,终点法检测(也称 “读板检测”)测量的是PCR循环结束时累计的PCR产物量。

关于序列检测试剂

我们开发了两种通过使用序列检测系统(SDS)仪器进行PCR产物检测的试剂:

Applied Biosystems TaqMan 试剂(也称“荧光5’核酸酶试剂”)Applied Biosystems SYBR Green I染料试剂

TaqMan方法

TaqMan方法通过采用荧光探针在PCR循环过程中随着特定PCR产物的累计而对其进行检测。

使用TaqMan方法的检测类型

TaqMan方法可用于以下检测类型: 定量,包括:

用于RNA定量的一步法RT-PCR用于RNA定量的两步法RT-PCRDNA/cDNA定量 等位基因检测通过IPC进行的正负检测

 SYBR Green I染料试剂

SYBR Green I染料法采用了Applied Biosystems SYBR Green I染料,一种可以在PCR循环过程中随着PCR产物的累计而对其进行检测的高度特异性双链DNA结合染料。TaqMan和SYBR Green I染料法最为重要的区别在于SYBR Green I染料试剂可以检测所有双链DNA,包括非特异性的反应产物。因此这样经过特别优化的反应体系,对于获取准确的结果而言是非常必要的。

使用SYBR Green I染料法的检测类型

SYBR Green I染料法可用于以下检测类型:

用于RNA定量的一步法RT-PCR用于RNA定量的两步法RT-PCRDNA/cDNA定量SYBR Green 预混液选择指南 >>

TaqMan试剂

最初,使用嵌入式染料进行实时荧光PCR (qPCR) 产物定量。但这些染料存在重大缺点,即会同时检测特异性以及非特异性PCR产物的扩增量。

TaqMan方法的开发

通过引入基于Taq DNA聚合酶5’核酸酶活性的荧光标记探针,实时定量PCR系统得到了显著提升。这些荧光探针的使用,使得实时定量的方法得到了发展,实现了仅对特定扩增产物的检测。此外,荧光标记探针的开发,也免去了用于探针降解分析的PCR反应后处理过程。

TaqMan序列检测方法的工作原理

TaqMan试剂通过采用荧光探针在PCR循环过程中随着特定PCR产物的累计而对其进行检测。工作原理:

步骤、过程

构建一段寡核苷酸探针:5’端标记荧光染料报告基团,3’端标记淬灭染料基团。当探针保持完整时,淬灭基团的靠近会通过空间上的荧光共振能力转移(FRET)而显著降低由报告染料基团发射的荧光。如果存在目标序列,探针便会在其中一个引物结合位点的下游发生退火,并随着引物的延伸通过Taq DNA聚合酶的5’核酸酶活性,完成切除。探针的切除将会引起: 将报告染料基团和淬灭染料基团进行分离,增强了报告染料基团的信号。将探针从目的链上去除,使引物继续沿模板链末端延伸。因此,探针的介入并不会抑制整个PCR过程。每经过一个循环,就会有

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