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875生物信息学考试大纲

生物信息学是一门综合交叉学科,是采用信息科学、计算机科学和数学等学科的观点和方法对生命的现象及其组成分子(核酸、蛋白质等)进行研究,主要研究生命中的本质和规律,包括物质组成、结构功能、生命体的能量和信息交换传递等。

知识结构:

★ 生物信息学概论和数据库

★ 序列数据的收集和存储

★ 基因组序列组装和基因注释

★ 基因结构元件识别和分析

★ 双序列与多序列比对

★ 数据库检索算法

★ 序列变异研究的算法与进化分析

★ 基因表达与调控网络

★ 表观遗传学数据分析

★ 蛋白质分类与结构预测

考核内容:

了解生物信息学概念、研究方向和发展趋势,并熟悉重要的生物信息中心和常用数据库。

了解不同类型序列数据的获取方式,掌握常用的序列存储格式及转换方式。

掌握常用序列联配算法,了解打分矩阵及空位罚分算法,并理解多重序列比对与进化分析的关系。

理解进化分析与亲缘树的关系,掌握三种进化分析算法(最大似然法、距离法和最大简约法)。

 掌握转录组分析基本方法,理解基因表达差异分析的算法。

 了解染色质免疫共沉淀技术,掌握ChIP-Seq数据处理流程和下游分析流程。

 掌握蛋白质结构的组成和层次,理解序列相似性与结构相似性同蛋白质分类之间的关系,掌握蛋白质结构预测方法,包括二级结构和三级结构。

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