注册环保工程师考试分为基础考试和专业考试，基础考试科目包括：公共基础、专业基础；专业考试科目包括：专业知识（上、下）和专业案例（上、下）。

1、基础考试内容：

公共基础：高等数学、普通物理、普通化学、理论力学、材料力学、流体力学、计算机应用技术、电工电子技术、工程经济;

专业基础：工程流体力学与流体机械、环境工程微生物学、环境监测与分析、环境评价与环境规划、污染防治技术及职业法规共15个科目。

2、专业考试内容：

环境法规与标准、水污染防治工程技术、污水处理与再生利用工程实践、大气污染防治工程技术、大气污染防治工程实践;

固体废物处理处置工程技术、固体废物处理处置工程实践、物理污染控制工程技术、物理污染控制工程实践共9个科目。

注册环保工程师考试教材包括《注册环保工程师考试大纲》、《注册环保工程师基础考试》和《注册环保工程师专业考试》，共一个大纲、两门考试用书。

按照国家注册环保工程师执业资格制度，全国勘察设计注册工程师环保专业管理委员会秘书处和中国环境保护产业协会组织环境工程领域的资深专家根据《注册环保工程师资格考试专业考试大纲》编写了《注册环保工程师专业考试复习教材》系列丛书，供环境工程专业技术人员参加注册环保工程师资格专业考试复习使用。

第一分册包括环境法规与标准概论、水污染防治工程基础和实践、大气污染防治工程基础与实践三篇;

第二分册包括固体废物处理处置工程基础与实践、物理污染防治工程基础与实践两篇;

第三分册为注册环保工程师应知应会的主要环境标准和规范汇编;

第四分册为考试复习手册，包括考试大纲、样题和部分环境法律法规、部门规章、技术政策等。

基础考试：是闭卷考试，不能自带资料，考试的时候，会发一本公式手册，但手册中的公式并不是很全，特别是化学和物理的公式很少。

专业考试：两天均是开卷考试，可以带任意的纸质资料，不能带电子资料，也不能用笔记本电脑，可以带一些设计手册，查些基础数据。

专业考试分为2天，第一天为专业知识考试，第二天为专业案例考试，考试时间每天上、下午各3小时。第一天为知识概念性考题，上、下午各70题，前40题为单选题，每题分值为1分，后30题为多选题，每题分值为2分，试卷满分200分;第二天为案例分析题，上、下午各25题，实行25道题必选必做的做答方式。每题分值为2分，满分100分。