中国农业科学院植物保护研究所创建于1957年8月，是首批成立的中国农业科学院五个直属专业研究所之一，现有职工236人，其中科技人员223人，中国工程院院士1人，国家杰出青年科学基金获得者5人、何梁何利基金科学与技术进步奖获得者2人，形成了一支以院士为龙头、高级科技人员为主体、青年优秀科技人才贮备丰厚、在国内外具有较高影响力的专业技术人才队伍。

研究所设有植物病害、农业昆虫、农药、生物防治、植保生物技术、生物入侵、杂草鼠害与草地植保等7个研究室，全面涵盖了当今植物保护学科的内容，建成了完整的现代植物保护学科领域。

研究所建成了由国家农业生物安全科学中心、植物病虫害生物学国家重点实验室和8个野外观测试验基地等组成的植物保护科技创新平台体系。近年来，获得各种科技成果奖励56项，其中国家科技进步奖6项，省部级奖32项，“中国小麦条锈病菌源基地综合治理技术体系的构建与应用”荣获2012年度国家科技进步一等奖。获国家发明专利446项，实用新型专利57项。审定农作物新品种6个，获得农药登记证32个，制定国家和行业标准750余项。累计发表论文9000多篇，其中SCI论文3300余篇。其中以第一单位或通讯单位在Cell Host等顶尖杂志上发表SCI论文17篇。