我院在国际贸易专业博士点学位授权的基础上，经过不懈的努力，在2004年教育部学位中心组织的一级学科整体水平评估中，应用经济学被评为全国第六名，其中科学研究和人才培养均列第四名。2006年1月，在国务院学位委员会下发的“关于下达第十批博士和硕士学位授权学科、专业名单的通知”文件中（学位[2006]3号），经国务院学位委员会第二十二次会议批准，对外经济贸易大学获得应用经济学博士学位一级学科的学位授权。
目前，我院拥有应用经济学（0202）一级学科博士点，从2007年开始招收区域经济学（020202）、财政学（含税收学）（020203）、金融学（含保险学）（020204）、产业经济学（020205）、国际贸易学（020206）、数量经济学（020209）六个二级学科博士生；建立了应用经济学博士后流动站。在“十五”建设期间，通过校内资源的深化利用，引进国际先进师资力量，博士点的研究以及培养力量得到了极大的充实，师资中不仅有来自美国、英国、加拿大、日本、新加坡、香港等国家和地区的教授和博士，他们同时带来了国际先进的研究方法以及专业发展的理念，而且还有国内培养成长起来的教学科研人员。严谨的治学理念、开放的学术氛围、合理的师资队伍为我院的博士生培养奠定了基础。
博士生导师队伍
020202区域经济学
洪俊杰020203财政学
杨志勇 孔淑红 毛程连 郑俊田 彭向刚020204金融学
林桂军孙华妤
徐信忠
门明
刘园
于瑾
刘树林
史燕平
蒋先玲
奉立城
吴青
陈欣
020205产业经济学
赵忠秀黄晓玲
魏巍贤
林伯强 王强 王薇020206国际贸易学
薛荣久王林生
林桂军
白树强
黄晓玲
唐宜红
夏友富
郭飞
卢进勇
赵忠秀
裴长洪
葛赢
洪俊杰
张宏霖
刘东升
朱明侠
孙玉琴
赖平耀
殷晓鹏 邵祥林 孔淑红 崔凡 王健 姚新超 杨长春 王强 陈欣020208统计学
张浩 王强 陈志鸿020209数量经济学
刘树林 陈志鸿020104西方经济学
奉立城 孙华妤 赖平耀020106人口、资源与环境经济学
魏巍贤